文档介绍：利用SSR标记进行家蚕部分品种资源的指纹图谱分析
侯成香1,李木旺1,张月华1,钱荷英1,孙平江1,徐安英1,苗雪霞2,郭秋红2,相辉2,黄勇平2
(1中国农业科学院蚕业研究所,镇江 212018;2中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所,上海 200032)
摘要:【目的】通过构建家蚕品种资源的指纹图谱,研究品种间的亲缘关系。【方法】用35个SSR标记研究96个家蚕品种资源的指纹图谱。【结果】这些SSR标记在家蚕品种间表现出丰富的多态性,等位基因数量在3~28个,,多态性指数(PIC)~,。根据各品种的指纹图谱,用Nei(1978)的方法计算了各品种间的遗传距离,,,并用UPGMA方法进行了聚类,得到的分子系统图与传统意义上的形态分类方法接近但存在一些微小的差异。根据遗传分析结果,探讨了家蚕的起源与进化关系。【结论】SSR标记是适于进行品种资源的指纹图谱分析和分子标记辅助育种的一种标记,可在家蚕核心种质资源库的构建中发挥主要作用。
关键词:家蚕;品种资源;SSR标记;指纹图谱
Analysis of SSR Fingerprints in Part of the Silkworm
Germplasm Resources
HOU Cheng-xiang1, LI Mu-wang1, ZHANG Yue-hua1, QIAN He-ying1, SUN Ping-jiang1, XU An-ying1,
MIAO Xue-xia2, GUO Qiu-hong2, XIANG Hui2, HUANG Yong-ping2
( 1Sericultural Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Zhenjiang 212018; 2Institute of Plant Physiology and Ecology, Shanghai Institutes for Biological Sciences, Chinese Academy of Sciences, Shanghai 200032 )
Abstract: 【Objective】The ic relationships among silkworm strains were analyzed by constructing their fingerprints. 【Method】35 SSR markers were used to construct 96 fingerprints of silkworm races. All of the SSR markers were polymorphic and unambiguously separated silkworm strains from each other. 【Result】 A total of 467 alleles were detected with a mean value of alleles/locus (range 3﹣28). The mean polymorphism index content (PIC) was (range ﹣). UPGMA cluster analysis of Nei’s ic distance grouped silkworm strains based on their origin. 【Conclusion】 The results indicated that SSR markers are an efficient tool for fingerprinting cultivars and conducting ic-diversity studies in the silkworm.
Key words: Silkworm (Bombyx mori L.); Germplasm; SSR marker; Fingerprint
0 引言
【本研究的重要意义】家蚕是重要的经济昆虫。长期以来,丝绸一直受到国际市场的欢迎,蚕丝业在中国、印度及其它的发展中国家扮演着重要的角色。家蚕品种资源是家蚕育种的基础[1],中国、日本、印度等国家共保存了数千份蚕种质资源(其中部分品种为重复保存)。中国是蚕丝业的发源地,有着丰富的蚕种质资源,中国农业科学院蚕业研究所保存了660个来自不同区域的不同化性、眠性的蚕品种,其中包括了来自中亚、欧洲、日本等国家和地区的蚕种质资源,并调查了家蚕品种资源的常规性状和特殊性状[2, 3]。部