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生物信息学作业.doc

上传人:1322891254 2015/11/13 文件大小:0 KB

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生物信息学作业.doc

文档介绍

文档介绍:~3000bp的核酸序列。(864 bp linear DNA)
>gi|315142881|gb|| Capsicum annuum prosystemin gene, promoter region
TGATTTAG
~800AA的蛋白质序列。(463AA)
>gi|314602031|gb|| Sequence 2 from patent US 7820398
VSSNSIQIGGLFPRGADQEYSAFRVGMVQFSTSEFRLTPHIDNLEVANSFAVTNAFCSQFSRGVYAIFGF
YDKKSVNTITSFCGTLHVSFITPSFPTDGTHPFVIQMRPDLKGALLSLIEYYQWDKFAYLYDSDRGLSTL
QAVLDSAAEKKWQVTAINVGNINNDKKDEMYRSLFQDLELKKERRVILDCERDKVNDIVDQVITIGKHVK
GYHYIIANLGFTDGDLLKIQFGGANVSGFQIVDYDDSLVSKFIERWSTLEEKEYPGAHTTTIKYTSALTY
DAVQVMTEAFRNLRKQRIEISRRGNAGDCLANPAVPWGQGVEIERALKQVQVEGLSGNIKFDQNGKRINY
TINIMELKTNGPRKIGYWSEVDKMVVTLTELPSGNDTSGLENKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNER
YEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGM

,用找到的蛋白质序列进行BLASTP比对。
(1)核酸比对结果:
(2)蛋白质比对结果:


,并用N-J法构建进化树。
-model进行同源建模。
(1)模板信息
(2)同源建模结构图: