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于童
南海深海微生物的分离培养及 4 株海洋新菌的分类
鉴定
学位论文答辩日期:2013 年月日
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学位论文作者签名: 签字日期: 年月日
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签字日期: 年月日签字日期: 年月
南海深海微生物的分离培养及 4 株海洋新菌的分类鉴定
摘要
海洋环境是地球上最大的生态系统,为海洋微生物提供了极其多样的栖息环
境。海洋微生物数量巨大,种类繁多;在海洋中,原核细胞的总数估计在 1029
左右。微生物资源如此丰富,其多样性等基础研究具有极其重要的作用。微生物
多样性的分子生物学研究手段迅猛发展,而培养方法的研究则相对滞后,不利于
更进一步研究微生物的各种生理生化特征以及更深入地开发微生物资源。
本论文获得南海一深海站点水样,现场对水样进行分离培养,对获得的细菌
菌株进行了 16S rDNA 测序鉴定,分析了其可培养细菌的多样性,并进行了高通
量分离培养方法的海上试验。另外,对分离自南太平洋的 3 株新菌,以及分离自
青岛文昌鱼繁殖区附近的 1 株海洋新菌进行了分类鉴定。
对于南海深海站点的水样,利用传统平板培养法,从 2216E 及海水 R2A 培养
基中分离保藏 403 株细菌,得到 392 株细菌的 16S rDNA 序列。结果表明,该区
域细菌分为 4 个类群:变形菌门(Proteobacteria),放线菌门(Actinobacteria),
拟杆菌门(Bacteroidetes)和厚壁菌门(Firmicutes), 其中变形菌门包括α-变形
菌纲和γ-变形菌纲。392 株菌共得到 44 个属,52 个种。发现无论是种类还是菌
株数量,α-变形菌纲均为优势类群。分离得到α-变形菌纲 20 个属,25 个种,共
223 株细菌,占总数的 %;得到γ-变形菌纲 7 个属 11 个种,共 44 株,占总
数的 %;得到放线菌纲 7 个属,7 个种,共 114 株,占总数的 %;得到
拟杆菌门 6 个属,7 个种,共 9 株;厚壁菌门 2 个属,2 个种,共 2 株。优势属
为气微菌属(Aeromicrobium), 赤杆菌属(Erythrobacter),远洋橄榄球形菌属
( Pelagibaca ), Roseivivax , 食烷菌属( Alcanivorax ), 鞘氨醇宝盒菌属
(Sphingopyxis), 类诺卡氏菌属( Nocardioides)。优势种为 Aeromicrobium
erythreum,Erythrobacter flavus,Pelagibaca bermudensis,Alcanivorax borkumensis,
Sphingopyxis baekryungensis,Roseivivax halotolerans,Nocardioides marinus,
Roseivivax lentus。
利用该区域海水进行微生物包埋及高通量培养的海上试验,发现通过简化的
微球包埋技术可以在船上制得符合后续筛选要求的微球,然而其高通量培养装置
仍需要进一步改进方能符合海上的各方面实验要求。
I
对南太平洋环流区的 3 株海水菌属(Aquimarina)的海洋新菌进行了鉴定,分
别为 S