文档介绍:内蒙古农业大学
硕士学位论文
西藏当雄地区传统发酵乳制品微生物宏基因文库构建与乳酸菌
生物多样性研究
姓名:张彦斌
申请学位级别:硕士
专业:食品科学
指导教师:孟和毕力格
20090601
摘要分析微生态环境中微生物多样性和分子生态学。中国传统发酵乳制品制作经过几千年的自然驯化,某些具有优良发酵特性的乳酸菌被保留下来。充分认识和了解这些传统乳制品中乳酸茵生物多样性,对我国传统乳制品开的甊肝仆计追治黾际酰跣蛄杏敕桥嘌妇育多样性,并且有潜在的新类型的乳酸菌资源。宏基因组的方法能绕过某些细菌难以纯培养的障碍,可以全面客观的和食用已有几千年的历史,其中蕴含着丰富的微生物资源,尤其是乳酸菌,发利用和工业化生产具有重要意义,同时也能为生命科学研究挖掘更多的生物资源提供理论指导。本研究运用宏基因组学思想,⊙分形生物的总菇ù撤⒔腿橹破废妇蹹的文库,通过全序列分析技术进行克隆文库筛选,研究西藏当雄地区传统乳制品中乳酸菌生物多样性。本实验构建了含鲅粜钥寺〉目寺∥目猓萌窒拗菩阅谇忻窤虷盖蟹治基因文库后,获得种。从中选择出代表性克隆进行测序,并将序列提交美国国家生物信息中心进行同源性比对。分析显示,个序列中有个与龃颗嘌种具有同源性,分别是德国氏乳杆菌保加利亚亚种、乳酸乳球菌乳脂亚种甤、乳酸乳球菌乳酸亚种嗜酸乳杆菌、瑞士乳杆菌⑹热攘辞蚓⒊δっ鞔榫δ亚种甿⒖7贫楦司、假单胞菌属虲。另外基因具有较高的同源性。这些研究说明该地区传统发酵乳制品存在较为丰富的乳酸菌系统发关键词:宏基因组;;克隆文库;甊簧锒嘌、産
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指导教师签名:童堑型逊指导教师签名:盔幺苎凇本人承诺:┲凌日期:垒丝坏┬堑期:地仝垒纽置旦内蒙古农业大学研究生学位论文独创声明导师指导研究生学位论文的承诺罚处理并承担相虐导师连带责任。内蒙古农业大学研究生学位论文版权使用授权书分内容C苣谌莩,采用影印、缩印或其他手段保存论文。本人申明所呈交的学位论文是我本人在导师指导下进行的研究地方外,论文中不包括其他人已经发表或撰写过的研究成果,也不包括为获得我校或其他教育机构的学位或证书而使用过的材料,与我一申请学位论文与资料若有不实之处,本人承担一切相关责任。期:获得的研究结果。如果违反,我必须接受按国家及学校有关规定的处本人完全了解内蒙古农业大学有关保护知识产权的规定,即:研究生在攻读学位期间论文工作的知识产权单位属内蒙古农业大学。本人保证毕业离校后,发表论文或使用论文工作成果时署名单位为内蒙古农业大学,且导师为通讯作者,通讯作者单位亦署名为内蒙古农业大学。学校有权保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子文档,允许论文被查阅和借阅。学校可以公布学位论文的全部或部论文作者签名:工作及取得的研究成果。据我所知,除了文中特别加以标注和致谢的同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示谢意。所呈交的学位论文是在我指导下独立开展研究工作及取得的研究结果,属于我现任岗位职务工作的结果,并严格按照国家及学校有关学术道德规范的规定要求而日
笥遥纬ざ仁手校畔⒘拷洗引言宏基因组学近代分子生物学研究发现,,许多基于蛄蟹治龅姆肿由镅Х椒ň陀υ硕生,大部分还是针对微生物保守的序列的分析。目前与此相关研究主要集中在探索微生物的基因序列,主要通过基因序列的系统进化研究使人们对环境微生物多样性的认识和分析趋于完整客观。随着序列分析与系统分类学的广泛应用以及不依赖于标准微生物培养技术的基因克隆等相关技术的快速发展,宏基因组学被建立并应用于环境生物多样性研究。等所创导的宏基因组工程技术蒆瓤冢低彻槟珊筇出了宏基因组的概念,中文文献中将其译为“宏基因组学”¨K然在部分文献中使用了全基因组文库一目阳⑷ɑ蜃槟袂狗ú庑、环境目眏、群体基因组⒅刈榛肪澄目““、土壤文库等,但在大多数的报道中都以“宏基因组学”佰谧魑其正式名称。其泛指某一自然环境中全部微生物的基因组群褪墙囟ɑ肪持械淖芴逡糯镏手苯涌寺到可培养的宿主细胞中。建立宏基因组文库,从所获得的重组克隆子中筛选活性物质和相关基因,避开了环境微生物分离培养的障碍,其研究策略克服了绝大多数环境微生物难以通过一般的传统实验方法分离培养的现实,在挖掘和利用未培养微生物资源、筛选新颖生物活性物质方面具有极其巨大的潜力‘薄:昊蜃檠ü苯从环境样品中提取全部微生物的菇ê昊蜃槲目猓没蜃檠У研究策略研究环境样品所包含的全部微生物的数量、组成及其群落功能,在短短几年内宏基因组学研究已渗透到各个领