文档介绍：论文作者签名:蝴盏垦苏州大学学位论文独创性声明本人郑重声明:所提交的学位论文是本人在导师的指导下,独立进行研究工作所取得的成果。除文中已经注明引用的内容外,本论文不含其他个人或集体已经发表或撰写过的研究成果,也不含为获得苏州大学或其它教育机构的学位证书而使用过的材料。对本文的研究作出重要贡献的个人和集体,均已在文中以明确方式标明。本人承担本声明的法律责任。日
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论文作者签名:蓝鉴垦日期:趔:::蚕五瑾垄二年一月解密后适用本规定。苏州大学学位论文使用授权声明日期:生:垒:本人完全了解苏州大学关于收集、保存和使用学位论文的规定,即:学位论文著作权归属苏州大学。本学位论文电子文档的内容和纸质论文的内容相一致。苏州大学有权向国家图书馆、中国社科院文献信息情报中心、中国科学技术信息研究所蚍绞莸缱映霭嫔、中国学术期刊馀贪电子杂志社送交本学位论文的复印件和电子文档,允许论文被查阅和借阅,可以采用影印、缩印或其他复制手段保存和汇编学位论文,可以将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索。涉密论文口本学位论文属,在非涉密论文囤
中文摘要基因芯片技术的概念来自计算机芯片,发展至今不十年。基因芯片技术以其大规模、快速、高效的获取相关生物信息而闻名。基因芯片的原始信息都贮存在基因芯片图像中。图像文件中并没有直接信号值,如靶点强度值、背景强度值等信息,必须通过图像处理提取才能得到各靶点的相应数据信息。本文在基因芯片图像处理与数据提取方面进行了有意义的研究。首先,在基因芯片图像预处理方面,本文根据基因芯片图像噪声的特点以及常用的滤波算法,提出了形状自适应瞬ǚ椒ā4朔椒ㄍü浠怀叨鹊亩ㄏ核自适应地为每个像素点选择邻域,同时由于离散余弦变换自身的特性,能够对图像进行有效的滤波。通过主观与客观评价,相比于其他基因芯片图像滤波方法,该方法能够比较好的抑制噪声。其次,在靶点分割方面,本文总结了常用的基因芯片图像分割方法,提出了改进的劾喟械惴指钏惴ā聚类算法在大数据量时的扩展性和效率都较理想,适用于基因芯片的图像分割处理。针对劾嗨惴ǖ娜钡悖文对其进行了改进。改进后的算法分类结果清晰,有效避免劾嗨惴ㄖ锌能出现的陷入局部最优或者产生空类的情况。通过与其它分割算法分割效果的对比,该方法具有一定的优越性。最后,在数据提取方面,对基因芯片图像的靶点信号强度与背景信号强度进行了提取与校正,并且运用散点图与图对数据进行了预处理。通过预处理,可以方便地判断基因是发生了上调还是下调。关键词:基因芯片,形状自适应琄聚类作者:胡益军指导老师:翁桂荣基于形状自适应幕蛐酒枷翊
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目录第一章绪论⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯·选题的依据和意义⋯⋯⋯⋯⋯¨⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯·基因芯片技术的国内外发展现状⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯基因芯片图像处理与数据提取的研究现状⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯本文各部分的主要内容⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯第二章基因芯片概况⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一基因芯片简介⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯基因芯片技术基本原理⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯基因芯片技术的应用领域⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯第三章基因芯片图像预处理⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯伪彩色处理⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯滤波处理⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.⒂嘞冶浠宦瞬ā。瞬ㄋ惴ㄐЧ钠兰邸第四章网格定位与靶点分割⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯基因芯片图像的网格定位⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯··.<⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯··‘..⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.指钏惴ㄐЧ钠兰邸第五章数据提取⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯基因芯片图像的靶点提取⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯··,:—
信号强度提取⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯数据预处理⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯‰⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯第六章总结与展望⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯”本文总结⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯展望⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯...⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯“参考文献⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯