文档介绍：中国海洋大学硕士学位论文

谨以此论文献给我最尊敬和崇拜的导师刘涛老师!

---------芮凤平

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中国海洋大学硕士学位论文

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中国海洋大学硕士学位论文

海带 EST-SSR 标记的开发及其遗传多样性研究

学位论文答辩日期:
指导教师签字:
答辩委员会成员签字:

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中国海洋大学硕士学位论文

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中国海洋大学硕士学位论文
独创声明
本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究
成果。据我所知,除了文中特别加以标注和致谢的地方外,论文中不包含其他人已
经发表或撰写过的研究成果,也不包含未获得(注:如没
有其他需要特别声明的,本栏可空)或其他教育机构的学位或证书使用过的材料。
与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示
谢意。

学位论文作者签名: 签字日期: 年月日
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学位论文作者签名: 导师签字:

签字日期: 年月日签字日期: 年月日

V
中国海洋大学硕士学位论文

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中国海洋大学硕士学位论文
海带EST-SSR标记的开发及其遗传多样性研究
摘要

海带(harina japonica)具有悠久的人工栽培历史,是我国海藻养殖中最重
要的种类之一,也是我国产量较高的大型海产经济藻类。我国的海带产量和养殖规
模均列世界首位。海带特征性的异型世代交替生活史使之成为藻类学和遗传学研究
的典型生物。但是由于海带中的多糖和酚类物质含量较高、染色体数目众多且基因
组较大,海带的分子遗传学研究进展仍较为缓慢。微卫星标记是一种重要的共显性
标记,已被广泛应用于品种分子鉴定、种群遗传结构评估、遗传连锁图构建与QTL
定位等工作中。目前为止,海带科SSR标记数量仍十分有限,极大地限制了海带分
子遗传学与分子育种研究工作的进展。
本研究从实验室已测序的荣福海带基因组和转录组数据中,研究了微卫星重复
序列的特征,发现其主要以二碱基和三碱基重复为主,其中二碱基以AC重复为主,
三碱基以TGC重复为主,其他碱基重复类型没有明显的偏爱性。从这些数据中共设
计了1120对引物,其中有1020对EST-SSR引物,100对DNA基因组SSR引物,选用四
个品系的海带DNA(蓬杂、平板菜、东方2号和爱伦湾)对这1120对引物进行多态性引
物的筛选,共得到146对具有多态性的引物,其中129对来自EST-SSR引物,17对来自
DNA基因组SSR引物。然后选用我国当前主要的海带养殖品种和种群(爱伦湾、福
建种、平板菜、三海、高家、早厚成、东方3号、蓬杂2号、荣福、东方2号)共30
株个体对这146对有多态性的引物再次进行了筛选,得到了52对多态性引物,共扩增
出134个等位基因,;,变幅为
~。在10个群体中,爱伦湾、东方3号、东方2号海带的多态位点比例最高,
%。早厚成海带的多态