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重复序列.doc

上传人:gumumeiying 2016/6/16 文件大小:0 KB

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重复序列.doc

文档介绍

文档介绍:单一序列(unique sequence) 又称非重复序列, 在一个基因组中一般只有一个拷贝。真核生物的绝大多数结构基因在单倍体中是单拷贝或几个拷贝(1~5 个拷贝)。基因组中有 10个到几千个拷贝的 DNA 序列。重复单元的平均长度约 300 b 中度重复序列(moderately repetitive sequence ) 一般是非编码序列,有十个到几百个拷贝,如 rRNA 基因和 tRNA 基因等。这类重复序列的平均长度大约为 300bp ,往往构成序列家族,常以回文序列形式出现在基因组的许多位置上, 有些同单一序列间隔排列。大部分中度重复序列与基因表达的调控有关, 包括开启或关闭基因的活性,调控 DNA 复制的起始,促进或终止转录等,它们可能是与 DNA 复制和转录的起始、终止等有关的酶和蛋白质因子的识别位点。 p。高度重复序列在基因组中重复频率高, 可达百万(106) 以上, 因此复性速度很快。在基因组中所占比例随种属而异,约占 10-60% ,在人基因组中约占 20% 。高度重复顺序又按其结构特点分为三种。(1 )倒位(反向)重复序列这种重复顺序复性速度极快,即使在极稀的 DNA 浓度下,也能很快复性,因此又称零时复性部分,约占人基因组的 5% 。反向重复序列由两个相同顺序的互补拷贝在同一 DNA 链上反向排列而成。变性后再复性时,同一条链内的互补的拷贝可以形成链内碱基配对, 形成发夹式或“+”字形结构。倒位重复(即两个互补拷贝)间可有一到几个核苷酸的间隔,也可以没有间隔。没有间隔的又称回文( palimdr - ome ),这种结构约占所有倒位重复的三分之一。若以两个互补拷贝组成的倒位重复为一个单位,则倒位重复的单位约长 300bp 或略少。两个单位之间有一平均 的片段相隔, 两对倒位重复单位之间的平均距离约 12kb ,亦即它们多数散布非群集于基因组中。(2 )卫星 DNA 卫星 DNA(satelliteDNA) 是另一类高度重复序列, 这类重复顺序的重复单位一般由 2-10bp 组成, 成串排列。由于这类序列的碱基组成不同于其他部份,可用等密度梯度离心法将其与主体 DNA 分开,因而称为卫星 DNA 或随体 DNA 。在人细胞组中卫星 DNA 约占 5-6% 。按照它们的浮力密度不同, 人的卫星 DNA 可分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ四种。果蝇的卫星 DNA 顺序已经搞清楚, 可分为三类,这三类卫星 DNA 都是由 7bp 组成的高度重复顺序:卫星Ⅰ为 5'ACAACT3', 卫星Ⅱ为 5'ACAAATT3' 。而蟹的卫星 DNA 为只有 AT 两个碱基的重复顺序组成。(3 )较复杂的重复单位组成的重复顺序这种重复顺序为灵长类所独有。用限制性内切酶 Hind Ⅲ消化非洲绿猴 DNA , 可以得到重复单位为 172bp 的高度重复顺序, 这种顺序大部份由交替变化的嘌呤和嘧啶组成。有人把这类称为α卫星 DNA 。而人的α卫星 DNA 更为复杂,含有多顺序家族。(4 )高度重复顺序的功能 a. 参与复制水平的调节反向序列常存在于 DNA 复制起点区的附近。另外,许多反向重复序列是一些蛋白质(包括酶)和 DNA 的结合位点。 b. 参与基因表达的调控 DNA 的重复顺序可以转录到核内不均一 RNA 分子中,而有些反向重复顺序可以形成发夹