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微生物遗传酵母菌遗传.ppt

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微生物遗传酵母菌遗传.ppt

文档介绍

文档介绍:微生物遗传酵母菌遗传
第一页,共25页
概论
酵母属于真核生物,是单细胞真菌,生长较快,目前已知有1000多种酵母。
可将酵母分成三类:形成孢子的株系属于子囊菌和担子菌。不形成孢子但主要通过芽殖来繁殖的称为不完全真菌,或者叫“假酵母”。
第二页,共25页
通过出芽进行无性生殖,也可以通过形成子囊孢子进行有性生殖。
无性生殖:在环境条件适合时,从母细胞上长出一个芽,逐渐长到成熟大小后与母体分离。
有性生殖:营养状况不好时,一些可进行有性生殖的酵母会形成孢子(一般是四个),在条件适合时再萌发。
酵母生活史
第三页,共25页
酵母的基因组和染色体
酵母基因组
1996年完成酿酒酵母全基因组的测序,是真核生物中最早被测序的生物。
12068kb;6607 ORFs。
平均每隔2kb就存在一个编码蛋白质的基因(线虫6Kb,人30Kb),即整个基因组有72%的核苷酸顺序由开放阅读框组成。
平均 。
第四页,共25页
Verified ORFs: 4726 → 4887 → 4952
Unerified ORFs: 1069 → 910 → 846
Dubious ORFs: 812 → 810
Graphical View of Protein Coding Genes
Oct 11, 2008
Dec 11, 2010
Oct 31, 2011
第五页,共25页
酵母染色体-16条染色体
染色体
长度(kb)
基因数
tRNA基因数
rRNA基因数
I
230
107
2
0
II
813
392
13
0
III
315
160
10
0
IV
1532
747
27
0
V
577
278
20
0
VI
270
130
10
0
VII
1091
515
36
140
VIII
563
276
11
0
IX
440
220
10
0
X
745
358
24
0
XI
667
314
16
0
XII
1078
506
22
0
XIII
924
457
21
0
XIV
784
398
16
0
XV
1091
566
20
0
XVI
948
461
17
0
总数16
12068
5885
275
140
第六页,共25页
酵母基因组特点
镶嵌结构
多数酵母染色体由不同程度的、大范围的GC丰富DNA序列和GC缺乏DNA序列镶嵌组成。这种GC含量的变化与染色体的结构、基因的密度以及重组频率有关。
第七页,共25页
GC含量高的区域一般位于染色体臂的中部,这些区域的基因密度较高;GC含量低的区域一般靠近端粒和着丝粒,这些区域内基因数目较为贫乏。
酵母的遗传重组即双链断裂的相对发生率与染色体的GC丰富区相耦合,而且不同染色体的重组频率有所差别,较小的Ⅰ、Ⅲ、Ⅳ和Ⅸ号染色体的重组频率比整个基因组的平均重组频率高。
第八页,共25页
酵母基因组遗传丰余的主要结构
DNA重复序列:如开放阅读框或者基因的间隔区包含大量的三核苷酸重复
染色体末端重复:具有长度超过几十个kb的高度同源区,它们是遗传丰余的主要区域 ,重组频繁。
单个基因重复:如rDNA
成簇同源区:位于多条染色体的同源大片段,各片段含有相互对应的多个同源基因,它们的排列顺序与转录方向十分保守,同时还可能存在小片段的插入或缺失。
第九页,共25页
31%编码蛋白质的酵母基因或者开放阅读框与哺乳动物编码蛋白质的基因有高度的同源性。
孤儿基因
酵母基因组中有10%基因(约653个)与其它生物中功能未知的蛋白质的基因具有同源性,被称为孤儿基因对或孤儿基因家族(orphan pairs or family);
约25%的基因(~1544个)则与所有已发现的蛋白质的基因没有同源性,属首次发现的新基因,是真正意义上的孤儿基因。这些孤儿基因的发现是酵母基因组计划的重要收获,
第十页,共25页