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质粒dna的提取、纯化和电泳检测.doc

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质粒dna的提取、纯化和电泳检测.doc

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文档介绍

文档介绍:-
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质粒DNA的提取、纯化和电泳检测
**料,可以插入到DNA或RNA分子的碱基之间,并在300 nm波长的紫外光照射下放射出荧光,所以可用来显现凝胶中的核酸分子。在适当的染色条件下,荧光的强度是同DN***段的大小〔或数量〕成正比。
核酸在溶液中由于磷酸基而带负电荷,在电场中向正极移动。DNA在琼脂糖凝胶中的电泳迁移速率主要取决于下面六个因素:
〔1〕样品DNA分子的大小:电泳时,线性双螺旋DNA分子是以头尾位向前迁移的,其迁移速度与分子量〔所含碱基〕的对数值成反比,这是因为大分子有更大的摩擦阻力。
〔2〕DNA分子的构象:分子量一样而构象不同的DNA分子,其迁移速率不同。在抽提质粒DNA过程中,由于各种因素的影响,使超螺旋的共价闭合环状构造的质粒DNA〔cccDNA〕的一条链断裂,变成开环DNA〔ocDNA〕分子,如果两条链发生断裂,就转变为线状DNA〔Liner DNA〕分子。这三种构型的分子有不同的迁移率。一般情况下,超螺旋型〔cccDNA〕迁移速度最快,其次为线状分子,最慢的是开环状〔ocDNA〕分子。
〔3〕琼脂糖浓度:琼脂糖浓度直接影响凝胶的孔径,一定大小的DN***段在不同浓度的琼脂糖凝胶中的泳动速度不同。通常凝胶浓度愈低,则凝胶孔径愈大,DNA电泳迁移速度越快,即分子量越大,选用的凝胶浓度应越小。
〔4〕电泳所用电场:低电压条件下,线性DN***段的迁移速率与所用电压成正比。电压愈高带电颗粒泳动愈快,但随着电场强度增加,高分子量DNA的泳动速率以不同幅度增加,因此凝胶电泳别离DNA的有效*围随着电压上升而减小,为了获得DN***段的最正确别离效果,电场强度应小于5V/cm。
〔5〕电泳缓冲液: 在进展分子电泳时所使用的缓冲溶液,用以稳定体系酸碱度。常见的核酸电泳缓冲液有:TAE、TBE、TPE和MOPS等。电泳缓冲液的作用:①维持适宜的pH。电泳时,正极发生氧化反响〔4OH-+4e-→2H2O+O2〕,负极发生复原反响〔4H++4e-→2H2〕,长时间的电泳将使正极变酸,负极变碱。一个好的缓冲系统应有较强的缓冲能力,使溶液两极的pH保持根本不变;②使溶液具有一定的导电性,以利于DNA分子的迁移,例如,~+离子,Na+离子的浓度太低时电泳速度变慢;太高时就会造成过大的电流使胶发热甚至熔化;③电泳缓冲液还有一个组分是EDTA,参加浓度为1~2mM,目的是螯合Mg2+等离子,防止电泳时激活 DNA酶,此外还可防止Mg2+离子与核酸生成沉淀。电泳缓冲液的组成和离子强度直接影响迁移率,当电泳液为无离子水〔如不慎在凝胶中忘记加缓冲液,即误用蒸馏水配置凝胶〕,溶液的导电性很少,带电颗粒泳动很慢,DNA几乎不移动;而在高离子强度下〔如错用10×电泳缓冲液〕,导电性极高,带电颗粒泳动很快,产生大量的热,有时甚至熔化凝胶或使DNA变性。
〔6〕温度:DNA在琼脂糖凝胶电泳中的行为受碱基组成和凝胶温度影响不明显。不同大小DN***段的相对电泳迁移率在4~30℃内无变化,一般琼脂糖凝胶电泳多在室温下进展