文档介绍：第五节数量性状基因座
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质量性状和数量性状的区别
质量性状
数量性状
①．
变异类型
种类上的变化
（
如红、白花
）
数量上的变化
量性状
统计分析
QTL定位的步骤
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QTL定位的步骤
（1）构建作图群体
适于QTL作图的群体是待测数量性状存在广泛变异，多个标记位点处于分离状态的群体。一般是由亲缘关系较远的亲本间杂交，再经自交、回交等方法构建。
常用的群体有F2群体、回交（BC）群体、双单倍体（doubled haploids, DH）群体，重组近交系（recombinant inbred lines, RIL）群体等。其中DH群体和RIL群体可以永久使用。
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QTL定位的步骤
（2）确定和筛选遗传标记
理想的作图标记应具备以下4个特征：
数量丰富
多态性好
中性
共显性
形态学标记（morphological marker）
蛋白质标记(protein marker)
分子标记(molecular marker)：或DNA标记。
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常用的分子标记
中文名称
英文名称
英文缩写
限制性长度片段多态性
Restriction fragment length
polymorphism
RFLP
扩增片段长度多态性
Amplified frangment length
polymorphism
AFLP
随机扩增多态DNA
Random amplified polymorphism DNA
RAPD
可变数目串联重复
Variable number of tandem
repeat
VNTR
微卫星
（简单序列重复）
Simple sequence repeat
SSR
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QTL定位的步骤
（3）检测分离世代群体中每一个体的标记基因型
用多态性分子标记检测分离世代群体中每一个体（系）的标记基因型值。
各种分子标记最后显示的都是电泳分离的带谱，所以个体的标记基因型需要将每个标记的带纹与亲本比较并赋值来记录，例如在共显性情况下，作图群体中应含有P1，P2和杂合型3种带型，这3种带型即代表某一分子标记的3种基因型。
如果将含有P1带型的个体赋值为1，P2带型的赋值为3，杂合体赋值为2，即可得到数据化的分子标记图。
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M&Q连锁
P1赋值为1 P2赋值为3
杂合体赋值为2
数据化的分子标记基因型
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表8-6 水稻窄叶青8×京系17F2群体部分数量性状值与RFLP标记基因型值
株号
数量型状
RFLP标记
生育期
株高
颖花数
RG573
RG13
RZ70
RG697
RG474
RG435
1
126
115
129
1
1
3
1
1
1
2
107
127
356
2
2
2
3
3
3
3
112
123
341
2
1
1
2
1
1
4
95
117
202
1
1
3
1
2
1
5
115
121
285
3
3
1
3
2
3
6
110
127
311
2
2
1
2
1
2
7
101
103
126
3
3
2
2
1
2
8
119
116
237
2
2
2
0
3
3
9
118
112
217
1
2
3
0
3
3
10
115
111
186
3
3
3
0
3
3
N
……
……
……
（4）测量数量性状
QTL定位的步骤
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QTL定位的步骤
（5）统计分析
用统计方法分析数量性状与标记基因型值之间是否存在关联，确定QTL在标记遗传图谱上的数目、位置，估计QTL的效应。
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QTL定位的步骤
QTL定位流程图
现在学****的是第16页