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(优选)第五节数量性状基因座
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前言
经典数量遗传分析法
分析控制数量性状表现的众多基因的综合遗传效应,但是无法鉴别基因的数目、单个基因在染色体上的位置和遗传效应。
作物分子标记+数量性状基因座(QTL)定位分析法
确定影响某一数量性状的基因在染色体上的数目、位置及其遗传效应。
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第五节数量性状基因座
一、QTL定位的原理和步骤
二、QTL定位的统计方法
三、QTL分析的应用前景
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一、QTL定位的原理和步骤
QTL(quantitativetraitloci):全称数量性状基因座,它指的是控制数量性状的基因在基因组中的位置。
QTL定位:也称QTL作图;借助分子标记,可以在染色体上检测出QTL,并可以确定影响某一数量性状的QTL在染色体上的数目、位置和遗传效应。
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QTL定位的原理
如果分子标记覆盖整个基因组,控制数量性状的基因(Qi)两侧会有相连锁的分子标记(Mi- 和Mi+ ),这些与Qi紧密连锁的分子标记将表现不同程度的遗传效应。
利用分子标记定位QTL(Qi),实质就是分析分子标记与数量性状基因座Qi的连锁关系,即利用已知座位的分子标记来定位未知座位的Qi,通过分子标记与Qi之间的重组率,来确定Qi的具体位置。
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图8-5QTL定位的基本原理示意图
单标记和单基因
M&Q不连锁
M&Q连锁
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构建作图群体
确定和筛选遗传标记
检测分离世代群体中每一个体的标记基因型
测量数量性状
统计分析
QTL定位的步骤
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QTL定位的步骤
(1)构建作图群体
适于QTL作图的群体是待测数量性状存在广泛变异,多个标记位点处于分离状态的群体。一般是由亲缘关系较远的亲本间杂交,再经自交、回交等方法构建。
常用的群体有F2群体、回交(BC)群体、双单倍体(doubledhaploids,DH)群体,重组近交系(recombinantinbredlines,RIL)群体等。其中DH群体和RIL群体可以永久使用。
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QTL定位的步骤
(2)确定和筛选遗传标记
理想的作图标记应具备以下4个特征:
数量丰富
多态性好
中性
共显性
形态学标记(morphologicalmarker)
蛋白质标记(proteinmarker)
分子标记(molecularmarker):或DNA标记。
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