文档介绍：转录组分析
研究背景：
RNA-Seq是通过结合实验和计算方法来鉴定生物样品中RNA序列的种类和丰度的一种技术。通过RNA-seq，我们就能够确定单链RNA分子中ATCG的顺序。整个过程主要包括：从细胞或组织中提取RNA分子转录组分析
研究背景：
RNA-Seq是通过结合实验和计算方法来鉴定生物样品中RNA序列的种类和丰度的一种技术。通过RNA-seq，我们就能够确定单链RNA分子中ATCG的顺序。整个过程主要包括：从细胞或组织中提取RNA分子、文库的构建以及后继的生物信息学数据分析。RNA-Seq技术具有许多早期研究方法（如：微阵列）所不具备的优点，如：RNA-Seq平台的高通量、新技术所带来的高灵敏度、发现新转录本、新基因模型以及非编码RNA的能力等。
RNA-Seq技术的到来，使人们认识到，无论是单细胞模式生物还是人类，我们对其转录组的认知异常匮乏。而RNA-Seq产生的新的数据，则可以帮助我们发现基因结构上的巨大差异、鉴定出新的转录本以及能够对small non-coding RNA和IncRNAs有着更好的了解。而且随着测序花费的降低，RNA-Seq的优势体现的更加明显。
服务流程:
样品选取
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利用Oligo-dT富集mRNA
mRN***段化
cDNA合成
末端修复、加polyA、加接头，PCR扩增
数据分析
测序方案：
内容：TotalRNA检测，普通转录组文库构建及测序及信息分析。
测序方式：HiseqPE125。
项目周期：有参45天，无参50天。
分析内容：
无参考基因组：

Reads的从头比对组装

、KEGG对差异基因进行功能富集分析

分析

有参考基因组：
(同无参)
Reads比对组装

、删除和连接体情况
、长度和覆盖度情况

SNV/Indel 分析
UTR分析

Non-coding RNA 分析

案例解读：
案例：通过poly(A)+ RNA-Seq分析Drosophila melanogast转录组的动态性
本项研究通过poly(A)+ RNA-Seq技术对果蝇的细胞系进行测序，鉴定出一批通过替换启动子和RNA剪接来转录出大量转录本的神经特异性基因。通过后继分析还发现，对于RNA剪接变化，组织间的差异要远远大于发育阶段间的差异。另外，发现性腺表达了成百上千的未知的蛋白编码和lncRNAs，其中一些甚至是反义转录的。显示了果蝇转录