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转录组测序数据分析流程.docx

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转录组测序数据分析流程.docx

文档介绍

文档介绍:#流程大放送#转录组测序数据处理和分析
介绍
转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总 和,包括mRNA和非编码RNA。相对于传统的芯片杂交平台,转录组测序无需预先针对已 知序列设计探针,即可对任意物种#流程大放送#转录组测序数据处理和分析
介绍
转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总 和,包括mRNA和非编码RNA。相对于传统的芯片杂交平台,转录组测序无需预先针对已 知序列设计探针,即可对任意物种的整体转录活动进行检测,提供更精确的数字化信号,更 高的检测通量以及更广泛的检测范围,是目前深入研究转录组复杂性的强大工具。基于高通 量测序平台的转录组测序技术能够全面获得物种特定组织或器官的转录本信息,从而进行基 因表达水平研究、新转录本发现研究、转录本结构变异研究等。
该技术可用于以下研究
观察疾病发生过程中病灶部位内部的基因表达水平变化
在肿瘤研究中,使用RNA-seq技术可以预测潜在的融合基因
新IncRNA预测和已知IncRNA表达水平研究
新物种的转录组数据构建和功能研究
数据分析流程图
原始测序数据 单样本
/荒选基因皓台的下游分析
[•基因调控功能分类
♦基国功能富集
•基因通路富集
•蛋白互作网络构建
m •样录调控网绪构建
•通路交互网路构建
•转录因于活性分析
•基因共上游调控元件顼测
.•IncRNA-mRNA表达关联性分析, \»ERN曲与基因互补性分析 J
预期图例展示
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示例图1差异表达基因筛选