文档介绍：蛋白质结构的层次
一级结构: 氨基酸序列
二级结构:α螺旋,β折叠等
超二级结构
结构域(domain)
三级结构:所有原子空间位置
四级结构:多亚基蛋白
蛋白质结构层次
(一)超二级结构 由若干相邻的二级结构元件组合在一起,彼此相互作用,形成的有规则的二级结构组合。 1、αα:由两股平行或反平行的右手螺旋段相互缠绕而成的左手卷曲螺旋或称超螺旋。 2、βαβ:由两段平行-折叠股和一段作为连接的螺旋组成。 3、ββ:由若干反平行折叠片组合而成。
六、超二级结构和结构域
起二级结构示意图
βαβ在蛋白质中(Rossmann折叠)
βαβ在蛋白质中
Rossmann折叠:由三段平行β股和两段α螺旋构成,
相当于两个βαβ单元组合在一起。
结构域:指多肽链在二级结构或超二级结构的基础上形成三级结构的局部折叠区,它是相对独立的球状实体,称为结构域。
结构域有时也指功能域。一般说,功能域是蛋白质分子中能独立存在的功能单位。功能域可以是一个结构域,也可以是两个或两个以上的结构域。
(二)结构域
单结构域和多结构域示例
结构域与多肽链之间的关系?
同一蛋白中结构域之间的关系?
结构域(domain)在空间上相对独立
免疫球蛋白
结构域
纤维蛋白
球状蛋白:自然界中远远多于纤维蛋
白,绝大多数功能蛋白(如酶,抗体
等)都是球状蛋白。
三级结构定义:指由二级结构元件(螺旋,折叠,转角,无规卷曲等)构成的总三维结构。包括一级结构中相距远的肽段之间的几何关系和侧链在三维空间中彼此间的相互关系。
简言之,是指蛋白质多肽链所有原子在空间上的排列。
七、球状蛋白与三级结构
(一)球状蛋白的分类
根据结构域类型大致分为四种
1、全-结构蛋白质
最多:反平行螺旋: 螺旋一上一下反平行排列,相邻螺旋间以环相连,形成似筒状螺旋束。
见page225 图5-36 A
2、,-结构(平行或混合型折叠片)蛋白质
以平行或混合型(含平行和反平行折叠股)折叠片为基础,连有螺旋。