文档介绍：R语言—介绍
学院:经济学院
作者:陈琪
R语言的由来
R语言是从S语言演变而来的。
S语言是二十世纪70年代诞生于贝尔实验室,由Rick Becker, John Chambers, Allan Wilks开发。
基于S语言开发的商业软件Splus,可以方便的编写函数、建立模型,具有良好的扩展性,取得了巨大成功。
1995年由新西兰Auckland大学统计系的Robert Gentleman和Ross Ihaka,编写了一种能执行S语言的软件,并将该软件的源代码全部公开,这就是R软件,其命令统称为R语言。
R软件简介
R是开源软件,代码全部公开,对所有人免费。
R可在多种操作系统下运行,如Windows、Linux和UNIX等。
R需要输入命令,可以编写函数和脚本进行批处理运算,语法简单灵活。
目前在R网站上约有两千多个程序包,涵盖了基础统计学、社会学、经济学、生态学、地理学、医学统计学、生物信息学等诸多方面。
网站—R的资源
R主页: .org
CRAN (Comprehensive R work),
-
CRAN的镜像站点 -/
注: prehensive R work
简称CRAN,提供下载安装程序和相应软件包
R程序包
为什么要安装程序包?
特定的分析功能,需要用相应的程序包实现。
例如:系统发育分析,往往要用到ape程序包,群落生态学vegan包等等。
程序包是什么?
R程序包是多个函数的集合,具有详细的说明和示例。
Window下的R程序包是已经编译好的zip包。
每个程序包包含R函数、数据、帮助文件、描述文件等。
常用R程序包
base- R 基础功能包
stats- R统计学包
nlme- 线性及非线性混合效应模型
Graphics- 绘图
lattice- 栅格图
ape- 系统发育与进化分析
apTreeshape- 进化树分析
seqinr- DNA序列分析
ade4- 利用欧几里得方法进行生态学数据分析
常用R程序包
cluster- 聚类分析
ecodist- 生态学数据相异性分析
mefa- 生态学和生物地理学多元数据处理
mgcv- 广义加性模型相关
mvpart- 多变量分解
nlme- 线性及非线性混合效应模型
ouch- 系统发育比较
BiodiversityR - 基于Rcmdr的生物多样性数据分析
vegan- 植物与植物群落的排序,生物多样性计算
常用R程序包
maptools- 空间对象的读取和处理
sp- 空间数据处理
spatstat- 空间点格局分析,模型拟合与检验
splancs- 空间与时空点格局分析
picante- 群落系统发育多样性分析
程序包使用
在菜单栏程序包选择加载程序包…
或者在控制台中输入如下命令:
library() ####()内为程序包名称
调用程序包内的函数与R内置的函数调用方法一样
查看帮助文件
如何知道stats程序包内部都有哪些函数?
最常用的方法:
1 菜单帮助>Html帮助
2控制台中输入library(help="stats")