文档介绍：长非编码RNA Long noncoding RNAs
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长非编码RNA是什么?
长非编码RNA是怎么发现的?
长非编码RNA有多少?
长非编码RNA的系统发现
RNA长度大于200nt
RNA不编码蛋白质
长非编码RNA定义
长非编码RNA发现历程
1989年 H19
1990年 Xist
2007年 HOTAIR
长非编码RNA是转录组的重要组成部分
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长非编码RNA(>20,000)
microRNA, piRNA
tRNA,rRNA,snoRNA等
ENCODE 2012
长非编码RNA的系统发现
Rinn et al. 2003, Genes Dev
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Rinn et al. 2007, Cell
231 HOX ncRNAs
Tiling Array
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长非编码RNA的系统发现
ChIP-Seq
Guttman et al. 2009, nature, 1600 RA
Khalil et al. 2009, PNAS, 3300 lncRNAs
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RNA-Seq
Guttman et al. 2 May 2010, Nature Biotechnology, 1140 new lncRNAs
Scripture
长非编码RNA的系统发现
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RNA-Seq
Trapnell et al. 2 May 2010, Nature Biotechnology, 3724 new lncRNAs
Cufflinks
长非编码RNA的系统发现
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Cole Trapnell: TopHat(2009), Cufflinks(2010)
PhD Steven Salzberg, University of Maryland
Lior Pachter, University of California, Berkeley
Postdoc Join Rinn’s lab, The Broad Institute
长非编码RNA的系统发现