NTsys-pc2.1图解使用说明.doc

文档介绍：NTsys-
数据的录入方法:
利用Ntedit直接录入数据
0、1二元数据中的数据缺失记为2。其中列标可以写为样品编号(条带编号), 栏中写入0、1数据总数, 栏中写入样品总数。文件另存为*.nts格式。
从excel表中直接读入数据
Excel表中输入数据格式如下图。A1必须为1,B1为0、1数据总数,C1为样品总数。
打开Ntedit程序,选择从Excel表输入,结果见上图。文件另存为*.Nts格式
从文本文件读取数据:
聚类分析
Ntsys-
以下以图中数据为例介绍聚类过程:
首先用similarity程序组中的Qualitative data计算形似系数矩阵。Coefficient通常选用SM 或DICE,结果输出到另一文件。
以上步的结果作为input file利用Clustering程序组中的SHAN或者Njoin进行计算,聚类分法选用UPGMA,ties选用FIND,Maximum no. tied trees至少大于样品数。
Njoin程序组界面如下,rooting method可以选用Outgroup,但需输入外元。
将SHAN或NJoin方法得到的tree file文件输入到Graphics程序组中的tree plot程序中计算
得到树图如下
利用options可以对树图进行描述与处理。