文档介绍：-nih-VERSION-IRIX64、xplor-nih-VERSION-Linux、xplor-nih-VERSION-db。下载地址:-nih/,要先注册才可以下载。,如/opt,命令如下。注意VERSION要换成实际安装的版本号cd/opt 进入到/opt目录下tar-xzvfxplor-nih-VERSION-–xzvfxplor-nih-VERSION--xzvfxplor-nih-VERSION--nih-VERSION进入安装目录./configure配置xplorln-s/opt/xplor-nih-VERSION/bin/xplor/usr/local/bin/xplor建立快捷方式4使用以下命令进行检测是否安装成功bin/:在命令行中输入“”就会启动xplor运行文件“”中的指令。输出信息默认显示于屏幕,可以使用“>”将输出信息存于当前目录下的“”文件中。:一般在文件开头使用remarks,文件中用!表示注释。Remarks主要是文件本身的说明如文件建立者,存放位置等:remarksfilegenerate/:!则是一般性的注释,其后的内容也不会运行。{}括号内的内容也不会被运行。:***@filename或者@***@filename。但是在循环语句如for循环中必须用@***@filename。如调用蛋白质结构文件时使用:******@()其中******@filenameend是调用结构文件的语句,类似的还有:******@TOPPAR:******@:调用pdb文件时没有”end”,因为pdb文件结尾已含有”END”。=文件名end例:writecoordinatesoutput==:Evaluate($parname=parvalue)可以在程序中使用变量如:Evaluate($parname=3)则变量“parname”被付值为3。以后可以使用“$parname”来调用它,如:Evaluate($a=$parname+3),命令执行后$a=6;:Set环境变量=环境参量值end其中xplor重要的环境变量有:Display:输出的信息显示位置,默认显示在屏幕上,等号后是要将输出信息保存到的文件名。MESSage=OFF|NORMal|ALL表示是否显示信息。OFF只显示重要输出信息,NORMal显示大部分信息,=ON|:SetDisplay=””\判断语句if(判断语句)thenXXXElseif(判断语句)thenXXXElseXXXendiffor$1in(abcde)loopmainXXXendloopmainfor循环括号中的变量是“$1”要取的值,可以结合原子选择语句来使用。(进行的操作)(所要操作原子)如:vectordo(X=Y+Z)(all).所有的原子x坐标变为其y,z坐标之和。其中X、Y、Z是xplor中每个原子都具有的固有属性即x、y、z坐标。vectordo(X=GAUSS())(nameca).将alpha碳的x坐标变成偏差1的高斯分布。“Name”是每个原子都具有的属性即“原子名”。( storeN )(所要选择原子) 将满足条件的原子存为storeN,其中N是数字,如:vectoride