拟南芥高亲和性K+载体蛋白基因cDNA克隆及其序列特征分析.doc

文档介绍：
拟南芥高亲和性 K+载体蛋白基因 cDNA 克
隆及其序列特征分析#
王丽1,2,3,张俊莲1,3,4,张金文1,3,4,刘玉汇1,3,白江平1,3,余斌1,3,杨宏羽1,3,4,
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王蒂1,3,4*
(1. 甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室,兰州 730070;
2. 甘肃农业大学生命科学技术学院,兰州 730070;
3. 甘肃省干旱生境作物学重点实验室,兰州 730070;
4. 甘肃农业大学农学院,兰州 730070)
摘要:以 NaCl 胁迫处理的拟南芥幼苗叶片为材料,用 RNA 提取试剂盒抽提总 RNA,通过
RT-PCR 技术和 DNA 序列测定分析,证实获得了拟南芥高亲和性 K+载体蛋白基因(AtHKT1)
的 cDNA 序列。该 cDNA 全长 1 521 bp,包括 506 个氨基酸和1个终止密码子序列,且与原
序列(accession number AF237672)同源性为 %,但与其他科植物 HKT1 基因同源性较
低,注册该基因到 GenBank 中,注册号为 AY685182。利用生物信息学相关软件分析预测
AtHKT1 基因蛋白质功能和结构,结果发现,该蛋白分子量为 ,理论等电点为 ;
氨基酸序列中第 1-40 个氨基酸属信号肽序列;第 152-500 个氨基酸属 Trk H 阳离子转运体
蛋白保守结构域,并存在蛋白激酶 C,酪氨酸蛋白激酶,依赖 cAMP/cGMP 蛋白激酶磷酸化,
糖基化和豆蔻酰化等功能位点;该基因编码的蛋白有 10 个跨膜结构,N 末端、C 末端及中
部等多个跨膜区具疏水性,符合载体类运输蛋白特点。表明本研究获得了拟南芥 AtHKT1
基因。
关键词:基因工程;拟南芥;高亲和性 K+载体蛋白;RT-PCR 技术;生物信息学分析
中图分类号:S336
Cloning and analysis of sequence characteristics of cDNA
encoding the AtHKT1 gene from leaves of Arabidopsis
thaliana
WANG Li1,2,3, ZHANG Junlian1,3,4, ZHANG Jinwen1,3,4, LIU Yuhui1,3,
BAI Jiangpin1,3, YU Bin1,3, YANG Hongyu1,3,4, WANG Di1,3,4
(1. Gansu Key Laboratory of Crop ic and Germplasm Enhancement, Lanzhou 730070;
2. College of Life Sciences and Technology,Gansu Agricultural University, Lanzhou 730070;
3. Gansu Provincial Key Lab of Aridland Crop Science, Lanzhou 730070;
4. College of Agronomic,Gansu Agricultural University, Lanzhou 730070)
Abstract: The full length coding sequence of AtHKT1 was cloned via RT-PCR(reverse
transcription-polymerase chain reaction) from leaves of Arabidopsis thaliana seedling under NaCl
stress. The full-length cDNA contained 1 521 bp and encoded polypeptide of 506 amino acids and
a termination codon. The sequence shared % homology with the reported sequence
(Accession Number AF237672), but the homologies were very pared with genes from
other plants. The gene was submitted to Genebank and the given registration number was
AY685182. The bioinformatics softwares were used to predict and