文档介绍:中南大学
硕士学位论文
鼻咽癌免疫编辑相关基因及免疫相关染色体异常区域初步筛选
姓名:周毅波
申请学位级别:硕士
专业:病理学与病理生理学
指导教师:姚开泰
20080501
摘要对实验室已有的鼻咽癌基因芯片结果设立筛选标准,找到在鼻咽鼻咽癌琋俏夜戏胶投涎歉发的上皮性恶性肿瘤,鼻咽癌患者的治疗方式主要是放疗。流行病学及病因学研究表明:⒒е掳┪锖遗传易感性与鼻咽癌发生密切相关。鼻咽癌的发生发展是一个多阶段、多途径的过程,涉及多个基因的改变,但关于鼻咽癌相关肿瘤免疫机制的研究并不多。年虳谙执庖哐Х⒄沟幕∩希菘煽康氖笛橹ぞ荩提出了肿瘤免疫编辑学说。肿瘤免疫编辑学说又称“学说’’,主要阐释肿瘤发展过程中免疫系统呈现的隽续的动力学时相:清除⑵胶及逃逸。该学说在阐明肿瘤的发生发展机制、指导肿瘤的免疫诊断和免疫治疗方面有重要意义。本研究小组前期工作曾多次进行鼻咽癌组织及细胞系基因芯片检测,探讨了众多基因与鼻咽癌发生发展的关系;并且结合多个实验室的鼻咽癌比较基因组杂交数据,以染色体区域为基本事件单位构建了鼻咽癌发生发展的树模型;而且对鼻咽癌细胞与细胞之间的相互免疫编辑作用关系进行了深入研究。本研究在研究小组前期工作的基础上,采用砑醪缴选潜在的鼻咽癌免疫编辑相关基因,再采用对所得结果进行初步验证,并且分析了鼻咽癌免疫相关基因所分布的染色体区域特点、这些染色体区域与染色体脆性位点及的关系。本研究为了解鼻咽癌发生发展过程中相关的肿瘤免疫机制提供了初步实验证据。实验方法和结果如下:第一部分鼻咽癌免疫编辑相关基因初步筛选癌细胞系高表达而在鼻咽癌组织中低表达的基因觯辉诒茄拾┫赴系低表达而在鼻咽癌组织中高表达的基因觥2捎肎掷喾椒从上述基因中筛选鼻咽癌免疫相关基因个。采用文献挖掘软件,将参与肿瘤免疫编辑的个基因与个在鼻咽癌细胞系和鼻咽癌组织中差异表达的免疫相关基因甈硕士学位论文中文摘要.
一起构建共发生网络,网络中相互关联基因个琁,编辑过程的免疫相关基因、、,相关基因个、篋、、、、,、,、和琁蜕涎麶是潜在的鼻咽癌免疫编辑相关基因。雕Ⅳ.、、:硎、甀、。进一步结合文献分析,筛选出隹赡懿斡氡茄拾┲,结果提示:、第二部分鼻咽癌免疫相关染色体异常区域初步筛选结合分类方法从本实验室已有的鼻咽癌基因芯片数据中筛选异常表达的免疫相关基因,发现处于扩增区域的表达上调鼻咽癌免疫相关基因个,其中个位于.、、和个位于虸;处于缺失区域的表达下调鼻咽癌免疫相关基因觯渲个位于、虸椅恢媒裘芟嗔冢硗个位于根据基于茄拾┳橹谋冉匣蜃樵咏皇莨菇ǖ谋茄癌发生发展的树模型提示的三个阶段,探讨了这些基因在鼻咽癌染色体异常区域分布的特点;在鼻咽癌免疫相关基因富集区域和找到龃嘈晕坏悖篎、对鼻咽癌染色体异常区域与鼻咽癌脆性位点进行比对,并筛选与这些区域可能相关的人类辉谡饬礁銮蚍⑾鋈个位于..甁、、/、....这些赡苡氡茄拾┑姆⑸芮邢喙亍采用文献挖掘软件将得到的各阶段鼻咽癌免疫相关基因一起构建共发生的基因关系网络。筛选出潜在的鼻咽癌免疫编辑本实验采用生物信息学方法从已有的基因芯片数据中筛选鼻咽和、、、ⅰ苐、、、、、、.。硕士学位论文中文摘要.
程中的作用机制需更多的体内外实验进行证实。癌免疫编辑相关基因及鼻咽癌免疫相关染色体异常区域,并进行了初步实验验证。结果提示、琁虸潜在的鼻咽癌免疫编辑相关基因;.和乔痹诘谋茄癌免疫相关染色体异常区域。但銮痹诘谋茄拾┟庖弑嗉喙鼗及銮痹诘谋茄拾┟庖呦喙厝旧逡斐G蛟诒茄拾┓⑸⒄构关键词:鼻咽癌,免疫编辑,免疫监视,树模型,砑生物信息学硕士学位论文中文摘要Ⅱ
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新签删嗍澎』月型日原创性声明学位论文版权使用授权书本人声明,所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。尽我所知,除了论文中特别加以标注和致谢的地方外,论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果,也不包含为获得中南大