常用生物数据库及数据格式 ppt课件.ppt

文档介绍：常用生物数据库和数据格式基本内容生物数据库相关背景常用数据格式fasta,fastq,gff,GenBank常用序列数据库美国国立生物技术信息中心(NCBI)欧洲生物信息学中心(EBI)DDBJ常用基因功能数据库基因本体数据库(GeneOntology)京东基因与基因组百科全书(KEGG)Interpro蛋白功能数据库常用基因组数据库UCSC基因组浏览器Ensembl基因组注释数据库23SequenceInterpro4?数据多,数据格式多,数据库也多。如何找到我们想要的数据库呢?5最新生物数据库列表(NucleicAcidsResearch)6基本内容生物数据库相关背景常用数据格式fasta,fastq,gff,GenBank常用序列数据库美国国立生物技术信息中心(NCBI)欧洲生物信息学中心(EBI)DDBJ常用基因功能数据库基因本体数据库(GeneOntology)京东基因与基因组百科全书(KEGG)Interpro蛋白功能数据库常用基因组数据库UCSC基因组浏览器Ensembl基因组注释数据库7常见数据格式88常见数据格式FASTAformatFASTQformatGenBankformatEMBLformatGFFformat99FASTAformat10描述行“>”分隔符一般50-100个字符每行没有标准的扩展名10