文档介绍:中国预防医学杂志年月第卷第期,,. · ·
【论著】
株浙江省结核分枝杆菌临床分离株
基因分型研究
柳正卫,吕冰,王晓萌,董海燕,何海波,赵秀芹,万康林
【摘要】目的初步探讨浙江省结核分枝杆菌的数目可变串联重复序列的分型及分布特征。方
法随机选取浙江省结核分枝杆菌临床分离菌株,常规培养,收集菌体,提取基因组,采用聚合酶链反应
分别对位点进行检测分析,基因分型聚类分析采用软件。结果对株结核分枝杆菌临
床分离株的个位点进行检测。结果显示明显的基因多态性。经基因聚类分析,可分个基因群群、Ⅱ
群、Ⅲ群、Ⅳ群,个基因型。分别为群占.% ,含个基因型, Ⅱ群占.% ,含个基因型,Ⅲ群占
.% ,含个基因型,Ⅳ群占.% ,含个基因型。结论初步证实浙江省结核分枝杆菌基因存在明显
的多态性,至少存在个型,主要流行型为Ⅲ型。
【关键词】结核病;结核分枝杆菌;基因分型;多为点数目可变串联重复序列分析
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随着分子生物学理论和技术的飞速发展,逐步建杆菌基因分型的基础。根据核酸序列进行菌株鉴定的
立了一些根据核酸序列进行菌株鉴定的高度特异的基高度特异的基因分型方法,主要有插入序列
因分型方法。年结核分枝杆菌, 限制性片段多态性
£全基因组测序工作的完成,显示,、多位点可变数目串联
结核分枝杆菌基因组高度保守,但存在与插人序列和重复序列分析
/或重复片段相关的多态区域⋯,这是现代结核分枝,、间隔区寡核苷酸
型,、
基金项目:浙江省医药卫生科技基金项目批准号: 多态富含的重复序列分析等。本研
和国家自然科学基金资助项目批准号: 究采用分型方法对浙江省的株结核分枝杆
作者单位:.浙江省疾病预防控制中心,杭州;.传
菌临床分离株进行了基因分型研究,以初步了解浙江
染病预防控制国家重点实验室,中国疾病预防控制中心传染病预防控
制所,北京两单位为同等贡献地区结核分枝杆菌的基因型分布特征及其流行情况,
通讯作者:万康林,:。探讨其在今后结核病控制中的应用价值。
中国预防医学杂志年月第卷第期,,】..
,水浴灭活,
材料和方法
在旋涡振荡器上震荡至块状固体菌落均匀溶于
. 菌株来源中,沸水浴,/离心,取上
株结核分枝杆菌菌株来源于—年浙清备用一℃冷冻保存。
江省耐药监测项目中从临床病人痰标本分离获得, .. —:采用反应体系,其
一℃的菌株库中保存。标准菌株中国疾病中包括模板、./,.Ⅱ
预防控制中心传染病所提供,作为本次试验的对照、。
菌株。分别用对引物进行扩增。反应条件:预
. 位点变性℃;循环,,
供选择个位点表引,其引物序℃.,共个循环;最后延伸。
列由中国疾病预防控制中心传染病所提供,由上海生.. 琼脂糖凝胶电泳:产物经%琼脂糖凝
物工程公司合成。胶恒电压/电泳, 染色,应用
作为