文档介绍：第十三章 DNA芯片技术
第一节概述
一、DNA芯片技术的概念
基因芯片(Gene chip)技术是指通过微阵列(Microarray)技术将高密度DNA片段阵列通过高速机器人或原位合成方式以一定的顺序或排列方式使其附着在如玻璃片等固相表面,以荧光标记的DNA探针,借助碱基互补杂交原理,进行大量的基因表达及监测等方面研究的最新革命性技术。
DNA Chip Technology
Solid support (glass, plastic, metal, silicon)
Miniaturized array of DNA (ic material)
Work on the biochemical principle of DNA/DNA hybridization
Hybridized probes (DNA molecules) are fluorescently labeled
通常用计算机硅芯片作为固相支持物,所以称为DNA芯片。
DNA芯片为生物芯片的一种:
生物芯片包括:
DNA芯片
蛋白质芯片
其它芯片
按用途分
样品制备芯片
生化反应芯片
检测芯片
芯片实验室是生物芯片技术发展的最终目标
基因芯片发展历史
Southern & Northern
Blot
Dot
Blot
Macroarray
Microarray
二、DNA芯片的主要类型
按制备方式分:
原位合成芯片:采用显微光蚀刻等技术在特定部位原位合成寡核苷酸而制备的芯片。探针较短
DNA微集阵列:将预先制备的DNA片段以显微打印的方式有序地固化于支持物表面而制成的芯片。探针的来源较灵活
Comparison of DNA Chip Technologies
Sensitivity of DNA chip based assays is a function of:
Probe and target DNA/RNA (Complexity)
Chip surface (autofluorescence & non-spec. bkg)
Attachment chemistry/methodology (hyb. efficiency & crosshyb.)
Hybridization efficiency (lots of factors)
Detection technology (signal type, efficiency, noise)
Oligo-Chip cDNA-Chip Genomic Chip
8 n or 20 n < 2,000 n > 50,000 n
sequencing
expression
expression
genomic analysis
第二节 DNA芯片技术的基本原理与方法