文档介绍：国防科学技术大学
硕士学位论文
miRNA靶标预测算法和靶标作用机制的研究
姓名:唐可成
申请学位级别:硕士
专业:计算机科学与技术
指导教师:骆志刚
20071101
要捅虺苖且焕喽韵赴伞⒋挥兄匾S跋斓姆潜嗦隦,而预测饔冒斜暧兄谌鲜镀渥饔没啤R谰葜肿油耆ヅ洹⒆杂赡芎捅J匦裕芯者已经提出了许多靶标预测算法,但由于对邪斜昊屏私庥邢蓿钟兴惴ㄎ蘼是敏感性还是特异性都不尽如人意。本文希望能通过改进现有的靶标预测算法,分析种子、自由能和保守性在斜暝げ庵械淖饔茫徊搅私鈓命中靶标的机制,提高靶标预测的敏感性。本文主要工作如下:岢隽艘恢中碌膍靶标预测算法。通过动态算法找出从碱基互补的角度所有可能斜辏缓笸ü肿油耆涠浴区域的绑定自由能和跨物种保守性对这些靶标进行筛选。橹@肨中真靶标的数据,比较了的敏感性,证明了在预测的靶标数近似的前提下,能预测到更多的真靶标,而且还证明了对不同谙赴械闹匾性有预测作用;此外,本文还通过计算信噪比和分析ざ扔朊写问墓系,证明了预测的结果是非随机的。ü旁氡确治觯颐腔狗⑾郑嬖诒J匦缘那疤嵯拢琺说牡谝桓龊偷诙个碱基的绑定在虬蠖ㄗ杂赡艿呐浜舷履苁筸靶标预测算法获得较高的特异性,而若以’端的碱基卜V肿樱材芊撬婊脑げ鈓靶标。关键字:斜暝げ猓肿樱杂赡埽J匦国防科学技术大学研究生院学位论文第
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学位论文作者签名::妒闕瑚加日日期:文。。辏脑H学位论文版权使用授权书日期:≯扩年,,除了文中特别加以标注和致谢的地方外,论文中不包含其他人已经发表和撰写过的研究成果,:学位论文作者签名:本人完全了解国防科学技术大学有关保留、,允许论文被查阅和借阅;可以将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索,可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、:.
第一章引言§课题背景年在甧体内又发现了另一种新的重要的!一’它长为个碱在生物细胞中,绝大多数的遣徊斡氲鞍字时嗦氲模宜侵械拇蠖嗍急蝗为是无用的垃圾。但随着研究的不断深入,人们发现这些不编码的堑ú皇抢是生命活动的重要参与者。它们会对的翻译和蛋白质的合成有着举足轻重的影响,以至对细胞和生物体的的生死有着不可忽视的作用。在本文中介绍的褪瞧渲械姆,简称侵赋ざ仍嘉黾罨男⌒头潜嗦隦家族。它通过作用于转录后的,从而对蛋白质的合成进行调节。经研究发现莝中的一大家族,并且很容易在线虫、苍蝇、植物和哺乳动物中发现,是目前被人们认为最重要的调节基因之一Ⅲ。年,