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文档介绍

文档介绍:dna指纹的遗传分析实验报告
DNA指纹的遗传分析
【实验原理】
“DNA指纹”是指可以利用DNA差异来进行与传统指纹分析相似的身份识别。DNA指纹是以DNA的多态性为基础,而卫星DNA的发现则是其最重要的奠基石。卫星DNA是由一mL,冰箱冷藏。
(9)无菌水:蒸馏水或去离子水,高温灭菌。
(10)1mol/L Tris-HCl(): Tris溶解在80mL蒸馏水中, ,加蒸馏水定容至100mL。
5(引物
Primer1:5’-GAAACTGGCCTCCAAACACTGCCCGCCG-3’
Primer2:5’-GTCTTGTTGGAGATGCACGTGCCCCTTGC-3’
【实验操作】
2
1(收集DNA样本
(1)先漱口,然后用灭菌的牙签充分擦刮口腔内壁,
装有1mL无菌水的小离心管中,使粘附在牙签表面的口腔细胞悬浮其中(以
能看到悬浮物为好)。震荡10s,10000 r/min离心1min。 (2)从离心管中吸出970μL无菌水,注意不要吸到沉淀。 (3)向离心管中加入200μL 5% Chelex 100,震荡10s混匀。 (4)加入2μL蛋白酶K,混匀,56?保温5min。 (5)剧烈震荡10s,沸水浴8min。
(6)10000r/min离心3min,离心管中溶液分成上下两层:下层为
Chelex100和细胞碎片的沉淀,上层溶液含DNA分子,可以直接用作PCR
模板。
此DNA样本可在4?或-20?保存,必要时可在使用前再次加热并离心,
使管内物质分层。
2(PCR扩增D1S80等位基因
(1) PCR管上做好标记。 (2)准备冰盒,开始反应前尽量使PCR管保持在冰上。 3)依次加入下列成分,配制25μL体系的PCR反应溶液: (
PCR pre-mix
引物1 1μL
引物2 1μL
口腔细胞DNA样本 10μL
加无菌水至总体积25uL。
(4)轻弹管壁,混匀溶液。
(5)离心10s,使管壁上的液滴落下。
(6)按下列程序开始PCR反应:
94?,1 min
,
94?,15s
68?,15s
72?,15 s
30个循环
,
72?,10min
,
4?暂时放置,直至开始电泳 3(PCR扩增产物鉴定与D1S80等位基因分析
(1)准备冰盒。
3
(2)取出完成反应的PCR管,放冰上待用。
(3)取出10µLD1S80 。
(4)加入2µL上样缓冲液。
(5)轻弹管壁混匀,再瞬时离心,使管壁上的液滴下落。
(6)用1×%琼脂糖电泳凝胶。
(7)60V预电泳1,2min。
(8)在凝胶上选一孔加6µLDNA相对分子质量标记(DNA100bpLadder)。
(9)每人将刚刚准备好的10µLD1S80 PCR扩增产物+2 uL的上样缓冲液各自加入凝胶样孔,注意不要有气泡进入。
(10)60V电泳30,40min。
(11)取出凝胶用清水漂洗5,10min。
(12)凝胶用紫外分析仪观察,记录每个个体的DNA条带数目及其位置。
4(观察和分析D1S80多态性。
四、结果与分析
本次实验所选择的方法是D1S80指纹图谱分析的常用方法。人群中
,。从理论上讲,可能存在435种不同的等位D1S80座位的杂合率约为86
基因组合。利用D1S80座位两侧序列设计的引物(Kasai et al,1990),通过PCR反应,很容易确定特定个体的D1S80等位基因构成,纯合体只有一条
杂合体有两条不同的DNA带。 DNA带,而
1(将小组的电泳结果拍照,附于下:
2(根据电泳结果,填写D1S80等位基因分析结果
4
DlS80 DNA指纹特征
小组成员 大小/bp 长度(重复数) 杂合/纯和
小组成员A 600 29 纯和
小组成员B 500 22 纯和
小组成员C 550 25 纯和 注:因为重复数为l的DIS80 PCR 产物长161bp,所以,重复数每增加一个,序列增加长度16 bp。据此可以催算:
重复数=1+(PCR产物大小,161)/16 【讨论】
,不是很清楚,原因可能是样品浓度过稀,也就是一开始刮取的口腔内壁细胞太少了,水浴时又洒了少许,以至于后来PCR也没扩增出。还有一个可能的原因就是DNA的纯度不够,带有太多的杂质,从而跑电泳时DNA被杂质阻滞,因此效果不太好。