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实验六碱法提取质粒.ppt

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实验六碱法提取质粒.ppt

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实验六碱法提取质粒.ppt

文档介绍

文档介绍:实验六碱法提取质粒
第1页,共34页,编辑于2022年,星期五
目 录 返回标题
一.目的
二.原理
附:原理示意图
三.试剂
四.器材
五.注意事项
六.操作步骤 1
六.操作步骤 2
六.操1 mol/L Tris·Cl ()
在800ml 水中加入 Tris-base, ,定容至1 L,分装后高压灭菌。
第13页,共34页,编辑于2022年,星期五
TE() back
10 mmol/L Tris·Cl () 1 mmol/L EDTA ()
第14页,共34页,编辑于2022年,星期五
50×TAE
242g Tris 碱
冰乙酸
100ml EDTA (pH )
1×TAE
mol/L Tris-乙酸
mol/L EDTA (pH )
第15页,共34页,编辑于2022年,星期五
四.器材
1. 恒温摇床
2. 超净工作台
3. 离心机
4. 电泳仪和电泳槽
5. 玻璃器皿与耗材
量筒、三角瓶、平皿;
EP管(, );
枪头(1ml, , 10μl);
牛皮纸、纱布、牙签等
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第16页,共34页,编辑于2022年,星期五
五.操作步骤 1
挑选一个单菌落,接种到含适当抗生素的3ml LB培养液中,37℃振荡培养14~16小时。
ml菌液,12,000rpm离心1分钟,收集菌体。
加入500μl~1ml STE buffer,涡旋打匀,12,000rpm离心1分钟,收集菌体。
加入预冷的溶液I 100μl,涡旋振荡充分悬浮,分散,混匀,冰浴5分钟 (重悬细胞)。
加入200μl溶液Ⅱ(现配),快速轻柔颠倒几次,直至溶液澄清,保持冰浴 (碱变性染色体DNA、蛋白质)。
在5分钟内,加入溶液III 150μl,轻柔颠倒5~10次,冰浴10分钟 (利用pH差异,复性质粒DNA)
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第17页,共34页,编辑于2022年,星期五
五.操作步骤 2
12,000rpm离心10分钟,沉淀染色体DNA,及不溶的变性蛋白,取上清。
上清液用Tris-HCl饱和苯酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)抽提1-2次,每次剧烈振荡20秒,12,000rpm 离心5分钟,可见溶液分三层,上层为质粒DNA溶液,中层为蛋白层,下层为酚层。
上清液用氯仿:异戊醇(24:1)抽提一次,12,000rpm离心10分钟。
上清液加入1/10体积 3M NaAc,2倍体积无水乙醇,混匀后,室温放置10-15分钟。
在12,000rpm离心10分钟得到质粒DNA沉淀。返回目录
第18页,共34页,编辑于2022年,星期五
五.操作步骤 3
去上清,加入1ml 75%乙醇,洗涤沉淀。
12,000rpm 离心10分钟。
去上清,吸出痕量剩余乙醇,风干。
加入30~50μl ddH2O或TE(pH ),溶解质粒。
加入RNaseA使终浓度为20μg/ml,室温放置30分钟~1小时。
1%琼脂糖凝胶电泳检测所提质粒DNA纯度及浓度。
取1-5μl DNA样品,加水稀释至1ml,混匀后转入 分光光度计的石英比色杯中,测定 OD260及OD280,并计算OD260/ OD280比值和DNA浓度:

DNA浓度= OD260×稀释倍数×50/1000 ( μg / μl )
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第19页,共34页,编辑于2022年,星期五
分次收集4ml菌液离心,留沉淀
第20页,共34页,编辑于2022年,星期五
五.操作步骤 4
琼脂糖(1%)凝胶电泳
称取一定量琼脂糖凝胶,按1g中100ml的量加入1×TAE,微波炉中加热约2min,使琼脂糖溶解;
溶液冷至60 ℃,加入 µg/ml,混匀,注意戴手套操作;
将琼脂糖倒入电泳板中,-,迅速插上梳子,检查有无气泡;
待凝胶完全凝固后(约30min),小心取出梳子,将凝胶板置于电泳槽中,加入1×TAE电泳buffer,让液面高出胶面1mm;
在DNA样品中加入1/6 loading buffer,混匀后用移液枪将样品加入样品孔中电泳,电压降选择为1-5V/cm (长度以两个电极之间的距离计算);
根据指示剂的位置,判断是否终止电泳。
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第21页,共34页,编辑于2022年,星期五
pGFP pBSK M
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