文档介绍：数量性状基因座演示文稿
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（优选）第五节数量性状基因座
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前言
经典数量遗传分析法
分析控制数量性状表现的众多基因的综合遗传效应，但是无法鉴别基因的数久使用。
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QTL定位的步骤
（2）确定和筛选遗传标记
理想的作图标记应具备以下4个特征：
数量丰富
多态性好
中性
共显性
形态学标记（morphological marker）
蛋白质标记(protein marker)
分子标记(molecular marker)：或DNA标记。
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常用的分子标记
中文名称
英文名称
英文缩写
限制性长度片段多态性
Restriction fragment length
polymorphism
RFLP
扩增片段长度多态性
Amplified frangment length
polymorphism
AFLP
随机扩增多态DNA
Random amplified polymorphism DNA
RAPD
可变数目串联重复
Variable number of tandem
repeat
VNTR
微卫星
（简单序列重复）
Simple sequence repeat
SSR
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QTL定位的步骤
（3）检测分离世代群体中每一个体的标记基因型
用多态性分子标记检测分离世代群体中每一个体（系）的标记基因型值。
各种分子标记最后显示的都是电泳分离的带谱，所以个体的标记基因型需要将每个标记的带纹与亲本比较并赋值来记录，例如在共显性情况下，作图群体中应含有P1，P2和杂合型3种带型，这3种带型即代表某一分子标记的3种基因型。
如果将含有P1带型的个体赋值为1，P2带型的赋值为3，杂合体赋值为2，即可得到数据化的分子标记图。
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M&Q连锁
P1赋值为1 P2赋值为3
杂合体赋值为2
数据化的分子标记基因型
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表8-6 水稻窄叶青8×京系17F2群体部分数量性状值与RFLP标记基因型值
株号
数量型状
RFLP标记
生育期
株高
颖花数
RG573
RG13
RZ70
RG697
RG474
RG435
1
126
115
129
1
1
3
1
1
1
2
107
127
356
2
2
2
3
3
3
3
112
123
341
2
1
1
2
1
1
4
95
117
202
1
1
3
1
2
1
5
115
121
285
3
3
1
3
2
3
6
110
127
311
2
2
1
2
1
2
7
101
103
126
3
3
2
2
1
2
8
119
116
237
2
2
2
0
3
3
9
118
112
217
1
2
3
0
3
3
10
115
111
186
3
3
3
0
3
3
N
……
……
……
（4）测量数量性状
QTL定位的步骤
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QTL定位的步骤
（5）统计分析
用统计方法分析数量性状与标记基因型值之间是否存在关联，确定QTL在标记遗传图谱上的数目、位置，估计QTL的效应。
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QTL定位的步骤
QTL定位流程图
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二、QTL定位的统计方法
单标记分析法
区间定位法
复合区间定位法
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二、QTL定位的统计方法
1、单标记分析法
若分子标记与QTL完全连锁或部分连锁就意味着标记本身就是QTL，或在标记附近存在QTL。
常用的检测单标记与QTL连锁的统计方法：
（1）方差分析：按标记基因型（MM、Mm、mm）将个体分组，进行单向分组的方差分析。若组间差异显著，说明QTL与标记连锁。
（2）回归或相关分析：对个体的性状值和标记基因型值进行回归