文档介绍:1
DNA提取方法
第一篇:DNA提取方法
各种DNA提取方法
一,基因组DNA提取方法
制备基因组DNA是进行基因结构和功能研究的重要步骤,通常要求得到的片段的长度不小于100-2022b。在DNA提取过程中应尽量
4、加入***仿/异戊醇(24:1)400ul,边加边摇,摇匀202212022rpm离心12min。
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5、取上层液350ul,加入另一新eppendorf管中,,摇匀2022室温放置15min,静置后的反应体系15000rpm离心12min,使沉淀紧贴eppendorf管壁。
6、弃异丙醇,加70%乙醇1ml(不振动),以15000rpm离心12min。
7、弃乙醇,敞开eppendorf管盖,烘干(37℃恒温箱)后,加1xTE溶液30ul,溶解DNA>12h以上,制成的DNA液-2022箱保存备用。
五,常用的外周血白细胞基因提取方法:
试验原理:
苯酚/***仿提取DNA是利用岘_Q______酚是蛋白质的变性剂,反复抽提,使蛋白质变性,SDS(十二烷基磺酸钠)将细胞膜裂解,在蛋白酶K、EDTA的存在下消化蛋白质或多肽或小肽分子,核蛋白变性降解,使DNA
从核蛋白中游离出来。DNA易溶于水,不溶于有机溶剂。蛋白质分子表面带有亲水基团,也容易进行水合作用,并在表面形成一层水化层,使蛋白质分子能顺利地进入到水溶液中形成稳定的胶体溶液。当有机溶液存在时,蛋白质的这种胶体稳定性遭到破坏,变性沉淀。离心后有机溶剂在试管底层(有机相),DNA存于上层水相中,蛋白质则沉淀于两相之间。酚-***仿抽提的作用是除去未消化的蛋白质。***仿的作用是有助于水相与有机相分离和除去
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DNA溶液中的酚。抽提后的DNA溶液用2倍体积的无水乙醇在1/103mol/LNaCl
存在下沉淀DNA,回收DNA用70%乙醇洗去DNA沉淀中的盐,真空干燥,用TE缓冲液溶解DNA备用。
试验步骤:
1、将1mlEDTA抗凝贮冻血液于室温解冻后移入5ml
离心管中,加入1ml磷酸缓冲盐溶液(PBS),混匀,3500rpm离心15min倾去含裂解红细胞的上清。重复一次。,37℃水浴温育1h。
2、将上述DNA提取液混悬白细胞,37℃水浴温育1h后,加入1mg/ml
至终浓度为100-2022g/ml
上下转动混匀,液体变粘稠。50℃水浴保温3h,裂解细胞,消化蛋白。保温过程中,应不时上下转动几次,混匀反应液。
3、反应液冷却至室温后,加入等体积的饱和酚溶液,温和地上下转动离心管5-10min,直至水相与酚相混匀成乳状液。5000rpm离心15min,用大口吸管小心吸取上层粘稠水相,移至另一离心管中。重复酚抽提一次。加等体积的***仿﹕异戊醇(24﹕1),上下转动混匀,
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5000rpm离心15min,用大口吸管小心吸取上层粘稠水相,移至另一离心管中。重复一次。
4、加入1/5体积的3mol/LNaAc及2倍体积的预冷的无水乙醇,室温下慢慢摇动离心管,即有乳白色云絮状DNA出现。用玻璃棒小心挑取云絮状的DNA,
离心管中,加70%,以5000rpm离心5min。洗涤DNA,弃上清,去除残留的盐。重复一次。室温挥发残留的乙醇,但不要让DNA完全干燥。加TE液2022
溶解DNA置于摇床平台缓慢摇动,DNA完全溶解通常需12-24h。制成的DNA液-2022箱保存备用。
六,真核细胞DNA的制备
一般真核细胞基因组DNA
有107-9bp,可以从新鲜组织、培养细胞或低温保存的组织细胞中提取,常是采用在EDTA以及SDS等试剂存在下用蛋白酶K消化细胞,随后用酚抽提而实现的。这一方法获得的DNA不仅经酶切后可用于Southern分析,还可用于PCR的模板、文库构建等实验。根据材料来源不同,采取不同的材料处理方法,而后的DNA提取方法大体类似,但都应考虑以下两个原则:
1、防止和抑制DNase对DNA的降解。
2、尽量减少对溶液中DNA的机械剪切破坏。试剂准备:
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1、TE:10mMTris-HCl();1mMEDTA()。
2、TBS:25mMTris-HCl();2022MNaCl;5mMKCl。
3、裂解缓冲液:250mMSDS;使用前加入蛋白酶K至100mg/ml。
4、2022DS
5、2mg/ml
蛋白酶K
6、Tris饱和酚()、酚/***仿(酚∶***仿=1∶1)、***仿
7、无水乙醇、75%乙醇
试