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水稻应答低能束辐照的基因芯片分析
周晓君,刘旭昊,郭向萌,押辉远洛阳师范学院生命科学系,河南洛阳
摘要目的探讨水稻应答束辐照机制中相关的表达差异。方法各选取组束辐照处理水稻种子和未处理的水稻
℃发芽幼苗总,采用单通道水稻基因表达谱芯片筛选组水稻幼苗差异表达基因。芯片中含有
探针个,分析其在样品间表达差异倍左右作为域值范围。结果辐照组与对照组相比表达差异显著的分子有
个,且均为下调。结论水稻束辐照组和对照组中存在差异表达的分子,可能调控某些基因的表达来应答离子辐照,从而表
现出与对照不一样的生理生化和表型差异。
关键词束;辐照水稻;;差异表达;基因芯片
中图分类号文献标识码文章编号——一
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简称是一类内源性长度为~ . 方法
个核苷酸的非编码小,通过与靶的互补配对而.. 低能离子束注人。选取饱满一致的水稻种子所有
在转录后水平上对基因的表达进行负调控,导致的降种子均来自同一单株,种胚朝上排放在注入盘上,真空×
解或翻译抑制。到目前为止,已报道有几千种存在接受低能的注人,注入剂量为”
于动物、植物、真菌等多细胞真核生物中,中也分别/。注人完毕后,部分种子立即在℃人工气候箱中
列出了和条拟南芥与水稻的。通黑暗条件和适当的湿度下发芽,以未注入的种子作为对
过介导降解、转录抑制、染色体修饰等方式参与细胞基照。以上处理做次重复。每个重复粒种子。
因表达的调控,进而参与多种生物功能调节,从而在多种非.. 的提取。试验前,将所用试剂和器皿按提
生物与生物胁迫响应中发挥重要作用。取试剂盒说明进行处理。经辐照后的种子,在适宜条件
自从余增亮等率先开展了利用低能束辐照农作物下发芽,每个处理从发芽盘中选取均一的幼苗株提
种子等的生物效应研究以来,用低能束辐照处理成为研取全株的总。提取方法见试剂盒说明书,提取完毕后用
究植物遗传育种、生长发育、胁迫响应等的重要手段。笔者处理样品,以除去其中的。不用辐照对照样
用低能束辐照处理的水稻提取,与先前制备的水稻品的水稻种子其制备步骤同上,重复次。
全基因表达谱芯片进行杂交,发现一些辐照处理水稻.. 活力指数的测定。发芽盘中剩下的幼苗作发芽率统
的量与对照相比,发生了显著变化。计,时计算发芽率,全株幼苗在℃烘干,称干重。
材料与方法.. 第链和第链一步法合成。取于
. ,配制反应溶液:. ,
子束生物工程重点实验室保存,基因芯片由生物芯片上海国.,. 。
家工程研究中心定制。低能离子束注入机型号为. 。保温,冰浴。将×.
.,.购自俄罗斯强电研究所,其工作真空度为在℃预热,加入./.,./
—。提取试剂、.,.,. ,总体
等试剂购自宝生物工程大连有限公司。仪积. ,将上述. 加入变性后冰浴的中。用
为Ⅳ公司一产品,基因芯片为水稻单通道枪头混匀,之后离心。热盖℃,℃反应,℃灭活
表达谱芯片,定制于生物芯片上海国家工程研究中心。,反应进行。
.. 标记合成。的配制