文档介绍:
TNF-α抑制剂治疗类风湿关节炎相关基因
的生物信息学分析#
李长征1,5,周淑清2,吕蔚然3,马利1,周烨4**
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(1. 南方医科大学南方医院中医内科,广州 510515;
2. 南方医科大学南方医院消毒供应中心,广州 510515;
3. 南方医科大学第一临床医学院,广州 510515;
4. 南方医科大学生物技术学院,广州 510515;
5. 南方医科大学中医药学院,广州 510515)
摘要:目的用生物信息学方法探讨 TNF-α抑制剂治疗类风湿关节炎的相关基因,为探讨
TNF-α抑制剂治疗类风湿关节炎的机制提供新思路。方法从基因芯片公共数据库 Gene
Expression Omnibus (GEO)中下载 TNF-α抑制剂治疗类风湿关节炎的相关基因芯片数据,利
用 String、KEGG、Panther 等在线分析软件对差异表达基因进行生物信息学分析。结果在
60 个差异表达基因所编码的蛋白中,有 29 个蛋白与其他蛋白存在相互作用关系,作用过程
涉及多种生物学通路,与多个生物学过程和分子功能相关。结论 TNF-α抑制剂治疗类风
湿关节炎涉及多基因相互作用,与 NF-κB 信号通路、MAPK 信号通路关系密切。
关键词:类风湿关节炎;TNF-α抑制剂;基因芯片;生物信息学
中图分类号:
Bioinformatic analysis of genes related to Rheumatoid
Arthritis treated by TNF-α inhibitor
LI Changzheng1,5, ZHOU Shuqing2, LV Weiran3, MA Li1, ZHOU Ye4
(1. Department of Chinese Internal Medicine, Nanfang Hospital, Southern Medical University,
GuangZhou 510515;
2. Central Sterile Supply Department, Nanfang Hospital, Southern Medical University,
GuangZhou 510515;
3. First Clinical Medical College, Southern Medical University, GuangZhou 510515;
4. School of Biotechnology, Southern Medical University, GuangZhou 510515;
5. School of Traditional Chinese Medicine, Southern Medical University, GuangZhou 510515)
Abstract: Objective To investigate the genes associated with Rheumatoid Arthritis treated by
TNF-α inhibitor with bioinformatics methods to provide new ideas f