甘蔗细胞色素P450还原酶基因的电子克隆与分析.doc

文档介绍：
甘蔗细胞色素 P450 还原酶基因的电子克隆
与分析#
苏炜华,张玉叶,黄宁,肖新换,黄珑,罗俊,阙友雄**
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(福建农林大学农业部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室/国家甘蔗产业技术研发中
心,福州 350002)
摘要:本研究以甘蔗类似细胞色素 P450 还原酶基因的 EST 序列 为探针,在甘蔗 EST 数据库中
进行检索,并基于电子克隆技术获得了甘蔗细胞色素 P450 还原酶基因(Cytochrome P450 reductase)的
一条 cDNA 全长序列,命名为 ScCYP450。采用生物信息学方法,对该基因编码蛋白从氨基酸组成、理化性
质、亚细胞定位、跨膜结构域、疏水性/亲水性、高级结构及功能域等方面进行预测和分析。分析表明该基
因全长 1821bp,包含一个 744bp 的开放阅读框,编码 247 个氨基酸,该基因编码蛋白定位于细胞内质网(膜),
为可溶性碱性蛋白,不存在信号肽,二级结构原件多为无规卷曲,含有多个保守功能域,主要功能为辅酶
因子生物合成和翻译功能。本研究为甘蔗细胞色素 P450 还原酶基因的实验克隆、功能鉴定及其应用提供参
考。
关键词:甘蔗;ScCYP450 基因;电子克隆;生物信息学
中图分类号:,
Electronic cloning and characterization of sugarcane
ScCYP450 gene using bioinformatics tools
SU Weihua, ZHANG Yuye, HUANG Ning, XIAO Xinhuan, HUANG Long, LUO Jun, QUE
Youxiong
(Key Laboratory of Sugarcane Biology and ic Breeding,Ministry of Agriculture,Fujian
Agriculture and Forestry University / Sugarcane Research & Development Center,China
Agriculture Research System,Fuzhou 350002, China)
Abstract: The full-length cDNA sequence of one sugarcane Cytochrome P450 reductase gene termed
ScCYP450, was obtained by in silico cloning using sequence from sugarcane as the probe
sequence. Using bioinformatics methods, several characters of ScCYP450 encoding amino acid,
including the amino position, physical and chemical properties, the subcellular localization,
the transmembrane doma