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肿瘤坏死因子-α和白细胞介素-17A对骨关节炎患者成纤维样滑膜细胞作用的生物信息学分析.pdf

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肿瘤坏死因子-α和白细胞介素-17A对骨关节炎患者成纤维样滑膜细胞作用的生物信息学分析.pdf

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文档介绍:1
·6· 风湿病与关节炎 年 9 月第9 卷第 9 期Rheumatism and Arthritis September 风湿病与关节炎 年 9 月第9 卷第 9 期Rheumatism and Arthritis September ·7·
·临床研究·
肿瘤坏死因子 -α 和白细胞介素 -17A 对骨关节炎患者
成纤维样滑膜细胞作用的生物信息学分析
邱志伟 1,2,3,梅阳阳 4,仲卫红 1,5,付长龙 1,2,3,谢新宇 1,2,3,牛晓敏 1,叶银燕 1
  【摘 要】目的:利用生物信息学方法分析肿瘤坏死因子 -α(TNF-α)和白细胞介素 -17A(IL-A)
对骨关节炎患者成纤维样滑膜细胞的作用机制。方法:从 GEO 数据库中下载 GSE93720 基因芯片数据集,
利用 GEO2R 筛选出差异表达基因。用 在线数据库对差异表达基因进行GO 分析和 KEGG 信
号通路分析,String 数据库构建蛋白质间相互网络,导入 软件进行可视化编辑,筛选出网
络中的核心基因,然后用 MCODE 插件进行子网络模块分析。结果:共筛选出差异表达基因 256 个,其
中上调基因 213 个,下调基因 43 个。差异最显著的 5 个基因是 Corf、CXCL8CCL、CXCL3
CXCR4。上调的差异基因 GO 分析主要涉及免疫反应、炎症反应、信号转导、细胞因子活性、趋化因子
活性等。上调的差异基因 KEGG 信号通路分析主要涉及细胞因子 - 细胞因子受体相互作用、肿瘤坏死因
子信号通