文档介绍:第二章
蛋白质化学
本章内容
第一节蛋白质的建筑构件—氨基酸
第二节蛋白质的共价结构
第三节蛋白质的高级结构
第四节蛋白质结构与功能的关系
第五节蛋白质的理化性质
第六节蛋白质分离与纯化技术
第二节蛋白质的共价结构
一、蛋白质中氨基酸的连接方式
二、肽键的结构和性质
三、肽的物理和化学性质
四、天然存在的活性肽
五、蛋白质一级结构测定
第二节蛋白质的共价结构蛋白质中氨基酸的连接方式
一、蛋白质的一级结构
蛋白质的一级结构(primary structure)是指蛋白
质分子中,从N-端到C-端氨基酸残基的排列顺序,即
氨基酸的线性序列。
在基因编码的蛋白质中,这种序列是mRNA中的核苷
酸序列决定的。
主要的化学键
肽键,有些蛋白质还包括二硫键。
氨基酸在蛋白质分子中的连接
肽键:α-羧基
α-氨基
脱水缩合
肽:氨基酸通过肽键连接
形成的化合物。
由两个氨基酸组成的肽称为二肽,由多个氨基酸组成的
肽则称为多肽(Polypeptide)。组成多肽的氨基酸单元
称为氨基酸残基(amino acid residue)。
肽链的写法与命名
游离的氨基在左,游离的羧基在右,氨基酸之间用
“—”表示肽键。
N末端 C末端
写法一: H2N—丙氨酸—酪氨酸—天冬氨酸—甘氨酸— COOH
写法二: Ala-Tyr-Asp-Gly (三字符)
写法三: A -Y -D -G (单字符)
命名为:某氨基酰某氨基酰。。某氨基酸
第二节蛋白质的共价结构肽键的结构和性质
刚性酰胺平面
C‐ C=
共振产生的结果:
产生键的平均化:
肽键呈反式构型并限制绕肽键的自由旋转
形成酰胺平面:由于肽键具有部分双键的性质,使
参与肽键构成的六个原子被束缚在同一平面上,这一
平面称为肽单元(酰胺平面,肽键平面)。
第二节蛋白质的共价结构肽键的结构和性质
刚性酰胺平面
多肽链可以看成由Cα串联起来的无数个酰胺平面组成
牛胰岛素的化学结构
A链 SS
21
H2N-Gly-Ile-Val-Glu-Gln-Cys-Cys-Ala-Ser-Val-Cys-Ser-Leu-Tyr-Gln-Leu-Glu-Asn-Tyr-Cys-Asn-
COOH
S S
B链 S S
H2N-Phe-Val-Asn-Gln-His-Leu-Cys-Gly-Ser-His-Leu-Val-Glu-Ala-Leu-Tyr-Leu-Val-Cys-Gly-
链内二硫键
30
Glu-Arg-Gly-Phe-Phe-Tyr-Thr-Pro-Lys-Ala-COOH 链间二硫键
一级结构的基本内容:
1、氨基酸排列顺序
2、二硫键形成方式
第二节蛋白质的共价结构
三、肽的物理和化学性质(了解)
、碱性质,它的解离主要来自游离末端
-NH2和游离末端-COOH以及侧链上可解离的基团。
:肽所带净电荷为“零”时,溶液的pH值。
Ala-Ala-Lys-Ala
+ +
NH3 NH3 NH2
pK - pK -
P COOH P COO PCOO
+ + +
NH3(ε) NH3(ε) NH3(ε)
+ + +
+ P+ P
P NH2 - -
pK -
PCOO pI = (+)/2
NH2(ε) =
P-