文档介绍：不完全病例-对照研究
基因环境交互作用的估计
Estimation of gene-environment interaction
in the partial case-control study
南京医科大学流行病与统计学系
柏建岭陈峰
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主要内容
¾ 基本原理
传统病例对照研究
单纯病例对照研究
不完全病例对照研究
¾ 应用
口服避孕药和 factor v leiden 基因突变与静脉血栓
栓塞的病例对照研究
¾ 讨论
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基本原理
z环境因素E
z 暴露:E=1; 未暴露:E=0
z基因因素G
z 突变基因型:G=1; 野生基因型:G=0
z疾病D
z 患者:D=1; 对照:D=0
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病例-对照研究数据整理表
表 1 病例-对照研究数据整理表
病例(D=1) 对照(D=0)
暴露基因(+) 基因(-) 基因(+) 基因(-)
合计
(G=1) (G=0) (G=1) (G=0)
+(E=1) X111 X101 X011 X001 X0+1
-(E=0) X110 X100 X010 X000 X0+0
X dge表示D,G,E的不同组合时的频数。
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情形1 表1资料齐全
——传统病例对照研究
常用logistic回归模型
(1)
logitP ()DG| ,E =+μα11E+β1G+γ1EG
对数线性模型(log-linear model)
(2)
logμ dge =+μα00E +β0G +γ0GE +μ1D +α1DE +β1DG +γ1DGE
logistic回归模型可以通过对数线性模型得到:
logitPD()|G,E=−logμ10ge logμ ge (3)
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情形2 只有病例资料而没有对照
——单纯病例研究(case-only study)
GE病例数对照数
++ a a0
+- b b0
-+ c c0
-- d d0
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单纯病例研究
logistic模型为
(4)
logitP (GE=1)=+β22γ
对数线性模型
logμ= αβ22E ++GGγ2E (5)
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情形3 不完全病例-对照资料。
病例-对照研究中
¾ 病例组:暴露、基因信息比较容易获得
¾ 对照组:暴露信息容易获得
基因信息未获得
在病例-对照研究中,当对照组缺乏基因信息时,
称为不完全病例-对照研究(partial case-control
study )。
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不完全病例-对照资料
GE病例数对照数
++ a a0
a0+ c0
+- b b0
b + d
-+ c c0 0 0
-- d d0
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不完全病例-对照研究的对数线性模型
对数线性模型(log-linear model)
logμdge =+ma00当 E+m1D+αβ3DE+3DG+γ3DGE (6)
α 3 表示暴露的主效应,其ML估计为:
XX 1111
OR ==exp()α 101 0+0 SE()α=+++
E 3 XX 3
100 0+1 XX101 0+0 X100 X0+1
XX
001 010 等于1时(此时,对照中基因型与环境暴露无关),暴露的
XX011 000
XX XX
OR ==101 0+0 101 000
主效应: E ,与模型(1)、(2)所得结果相同,但标准
XX100 0+1 XX100 001
误要小一些。
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